常用的光學顯微鏡有金相顯微鏡、熒光顯微鏡、生物顯微鏡、體視顯微鏡、倒置顯微鏡、偏光顯微鏡、相襯顯微鏡等。所以在選購顯微鏡前，一定要根據所需來選擇哪種顯微鏡適合自己。

一 、金相顯微鏡

金相顯微鏡放大倍數在50X-1000X這個范圍內，主要應用于金屬等多種不透明材料觀察，鑒別和分析內部結構組織。適用于廠礦企業、高等院校及科研等部門。該儀器配用攝像裝置,可攝取金相圖譜,并對圖譜進行測量分析,對圖象進行編輯、輸出、存儲、管理等功能。金相顯微鏡是專門用于觀察金屬和礦物等不透明物體的顯微鏡，這些不透明物體無法在普通的透射光顯微鏡中觀察，故金相顯微鏡主要以反射光為主。在金相顯微鏡中照明光束從物鏡方向射到被觀察物體表面，被物面反射后再返回物鏡成像。這種反射照明方式也廣泛用于集成電路硅片的檢測工作。現在的金相顯微鏡也可以選擇帶透射光的，方便觀察透明狀物體和一些粉末狀顆粒狀樣品。

二、熒光顯微鏡

熒光顯微鏡是以紫外線為光源，用以照射被檢物體，使之發出熒光，然后在顯微鏡下觀察物體的形狀及其所在位置。熒光顯微鏡用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等。細胞中有些物質，如葉綠素等，受紫外線照射后可發熒光;另有一些物質本身雖不能發熒光，但如果用熒光染料或熒光抗體染色后，經紫外線照射亦可發熒光，熒光顯微鏡就是對這類物質進行定性和定量研究的工具之一。

熒光顯微鏡一般分為透射和落射式兩種類型。透射式：激發光來自被檢物體的下方，聚光鏡為暗視野聚光鏡，使激發光不進入物鏡，而使熒光進入物鏡。它在低倍情況下明亮，而高倍則暗，在油浸和調中時，較難操作，尤以低倍的照明范圍難于確定，但能得到很暗的視野背景。透射式不使用于非透明的被檢物體。落射式：透射式目前幾乎被淘汰，新型的熒光顯微鏡多為落射式，光源來自被檢物體的上方，在光路中具有分光鏡，所以對透明和不透明的被檢物體都適用。由于物鏡起了聚光鏡的作用，不僅便于操作，而且從低倍到高倍，可以實現整個視場的均勻照明。

三、生物顯微鏡

生物顯微鏡放大倍數一般在40X-2000X之間,光源為透射光。生物顯微鏡供醫療衛生單位、高等院校、研究所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，同時可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體。可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。

四、體視顯微鏡

體視顯微鏡又稱"實體顯微鏡"或"解剖鏡"，是一種具有正像立體感的目視儀器。體視顯微鏡放大倍數在7X-45X左右,也可以放大到90X,180X,225X。在生物、醫學領域廣泛用于切片操作和顯微外科手術；在工業中用于微小零件和集成電路的觀測、裝配、檢查等工作。它利用雙通道光路，雙目鏡筒中的左右兩光束不是平行，而是具有一定的夾角--體視角（一般為12度--15度），為左右兩眼提供一個具有立體感的圖像。它實質上是兩個單鏡筒顯微鏡并列放置，兩個鏡筒的光軸構成相當于人們用雙目觀察一個物體時所形成的視角，以此形成三維空間的立體視覺圖像。

目前體視顯微鏡的光學結構是由一個共用的初級物鏡，對物體成象后的兩光束被兩組中間物鏡----變焦鏡分開，并成一體視角再經各自的目鏡成象，它的倍率變化是由改變中間鏡組之間的距離而獲得的，因此又稱為"連續變倍體視顯微鏡"。隨著應用的要求，目前體視顯微鏡可選配豐富的選購附件，如熒光，照相，攝象，冷光源等等。