（1） 中心照明：這是zui常用的透射式照明法，其特點是照明光束的中軸與顯微鏡的光軸同在一條直線上。它又分為“臨界照明”和“柯勒照明”兩種。 
    A． 臨界照明（Critical illumination）:這是普通的照明法。這種照明的特點是光源經聚光鏡后成像在被檢物體上，光束狹而強，這是它的優點。但是光源的燈絲像與被檢物體的平面重合，這樣就造成被檢物體的照明呈現出不均勻性，在有燈絲的部分則明亮；無燈絲的部分則暗淡，不僅影響成像的質量，更不適合顯微照相，這是臨界照明的主要缺陷。其補救的方法是在光源的前方放置乳白和吸熱濾色片，使照明變得較為均勻和避免光源的長時間的照射而損傷被檢物體。 
    B． 柯勒照明：柯勒是十九世紀末蔡司廠的工程師,為了紀念他在光學領域的突出貢獻,后人把他發明的二次成像叫做柯勒照明. 柯勒照明克服了臨界照明的缺點，是研究用顯微鏡中的理想照明法。這中照明法不僅觀察效果佳，而且是成功地進行顯微照相所必須的一種照明法。光源的燈絲經聚光鏡及可變視場光闌后，燈絲像*次落在聚光鏡孔徑的平面處，聚光鏡又將該處的后焦點平面處形成第二次的燈絲像。這樣在被檢物體的平面處沒有燈絲像的形成，不影響觀察。此外照明變得均勻。觀察時，可改變聚光鏡孔徑光闌的大小，使光源充滿不同物鏡的入射光瞳，而使聚光鏡的數值孔徑與物鏡的數值 孔徑匹配。同時聚光鏡又將視場光闌成像在被檢物體的平面處，改變視場光闌的大小可控制照明范圍。此外，這種照明的熱焦點不在被檢物體的平面處，即使長時間的照明，也不致損傷被檢物體。2004年蔡司公司又在傳統柯勒式照明基礎上推出了帶有反光碗的全系統復消色差照明技術，消除照明色差，增強光的還原性，進而提高分辨率，同時照明均勻而光效高。 
    （2） 斜射照明：這種照明光束的中軸與顯微鏡的光軸不在一直線上，而是與光軸形成一定的角度斜照在物體上，因此成斜射照明。相襯顯微術和暗視野顯微術就是斜射照明。 
      2． 反射式照明 
    這種照明的光束來自物體的上方通過物鏡后射到被檢物體上，這樣物鏡又起著聚光鏡的作用。這種照明法是適用于非透明物體，如金屬，礦物等。