顯微鏡的基本結構可分為光學系統、光源照明系統和機械裝置三部分。下面分別對它們予以介紹。
一、生物顯微鏡的光學系統
顯微鏡的光學系統主要包括物鏡、目鏡、聚光鏡和光源系統四個主要部件。其次還包括濾光片、載玻片和蓋玻片。

（一）物鏡
物鏡一般都是在物鏡轉換器上旋著。它是顯微鏡的*主要部件。顯微鏡的放大及分辨作用主要由它來擔當。其優劣直接決定了顯微鏡的主要光學性能。普通物鏡的結構如圖10-2-1所示。



為了校正像差和色差（所謂像差是指所成的像與原物在形狀上的差別，色差是指所成的像與原物在顏色上的差別），物鏡都由多塊透鏡組成，而且放大倍數越高，結構越復雜。
普通物鏡所觀察到的像面總有些彎曲，即靠中間部分清晰，靠邊緣部分比較模糊。要想讓邊緣清楚，需要調節顯微鏡的微調鈕。但是邊緣部分清楚后，中間部分又變得模糊了。這除了不便觀察外，更主要地是無法對其進行攝影。平場物鏡可以較好地校正像面彎曲，使視場平坦。但其結構也相應地復雜些。
現在，多數高倍物鏡和油鏡內都裝有彈簧。在物鏡前端受壓時，鏡頭可以退縮回來。這樣一方面可以保護鏡頭，另一方面也不會把載玻片和蓋玻片壓碎。這種物鏡稱為彈簧物鏡。

１、物鏡的分類  顯微鏡的物鏡雖然細分起來多達數百種，但是一般可采用下述三種分法：
（１）按物鏡使用空間介質的不同可分為：
干燥系物鏡：使用時，物鏡與標本之間以空氣為介質。
油浸系物鏡：簡稱油鏡。使用時，物鏡與標本之間以油類為介質。
（２）按物鏡的放大倍數不同，可分為：
低倍物鏡：放大10倍以下；
中倍物鏡：放大10～25倍：
高倍物鏡：放大40～80倍；
油鏡：放大倍數一般為100倍。　
（３）按物鏡對像差和色差的校正程度不同，可分為：
消色差物鏡（ACH）；
復消色差物鏡（APO）；
平場消色差 物鏡（PLAN ACH）；
平場半復消色差物鏡；
平場復消色差物鏡（PLAN APO）。
這五種物鏡的區別主要是消除色差與校正場曲的程度不同。其性能和復雜程度均是遞增的。即平場復消色差物鏡質量*好，但其價格也*高，結構也*復雜。

２．物鏡的識別   物鏡通常都標有表示物鏡光學性能和使用條件的一些數字和符號。如“40/0.65”和“160/0.17”。此處的40表示它的放大倍數（有的寫成40×或40：1）；0.65表示它的“數值孔徑”（有的寫成N.A.0.65或A. 0.65）；160表示使用該物鏡時，顯微鏡的機械筒長應為160mm（所謂機械筒長是指取下物鏡和目鏡以后，所剩下的鏡筒長度。顯微鏡的機械筒長現已統一規定為160mm）；0.17表示使用該物鏡時，蓋玻片的厚度應為0.17mm。有些低倍物鏡，在有、無蓋玻片的情況下都可以使用，所以不標0.17 而代之以橫線“－”。有些油鏡上標有“油（或oil）”字。