目前，不僅有能放大千余倍的光學顯微鏡，而且有放大幾十萬倍的電子顯微鏡，使我們對生物體的生命活動規律有了更進一步的認識。在普通中學生物教學大綱中規定的實驗中，大部分要通過顯微鏡來完成，因此，顯微鏡性能的好壞是做好觀察實驗的關鍵。顯微鏡的種類很多，本篇主要淺談電子顯微鏡與光學顯微鏡的區別。

概括起來，電鏡與光鏡主要有以下幾個方面的區別

一、部件不同

電子顯微鏡有三部分，分別是鏡筒、真空裝置和電源柜。而光學顯微鏡主要由四個部件組成，分別是物鏡、目鏡、反光鏡和聚光器。

二、成像原理不同。

電子顯微鏡是用電子束來穿透樣本，然后再由透鏡放大成像。而光學顯微鏡主要是利用凸透鏡的放大成像原理來放大樣本成像的。

三、照明源不同

電子顯微鏡所用的照明源是電子槍發出的電子流；而光學顯微鏡的照明源是可見光（日光或燈光），由于電子流的波長遠短于光波波長，故電鏡的放大及分辨率顯著地高于光鏡。

四、透鏡不同

電子顯微鏡中起放大作用的物鏡是電磁透鏡（能在中央部位產生磁場的環形電磁線圈）；而光學顯微鏡的物鏡則是玻璃磨制而成的光學透鏡。電子顯微鏡中的電磁透鏡共有三組，分別與光鏡中聚光鏡、物鏡和目鏡的功能相當。

五、用途不同

電子顯微鏡由于分辨率高，因此可以用來觀察普通顯微鏡所不能分辨的細微物質結構，還能用來幫助做物質成分的分析。光學顯微鏡主要用于生物、醫藥方面對微觀物質的觀察，以及作為教學當中學生的實驗用具。