自動聚焦顯微鏡主要用于觀察什么？自動聚焦顯微鏡可對金屬、陶瓷、巖石等材料以及各種固體材料的微觀形貌觀察和微區元素成分、線分布、面分布等分析納米技術、材料、物理、化學、環境科學等領域。除了實驗室里的各種微小的樣品，其實自動聚焦顯微鏡也可以在很多地方用到。

1、測繪工程領域：大壩和電站基礎地形測量、公路測繪，鐵路測繪，河道測繪，橋梁、建筑物地基等測繪、隧道的檢測及變形監測、大壩的變形監測、隧道地下工程結構、測量礦山及體積計算，顯微鏡都可以用到。

2、結構測量方面：橋梁改擴建工程、橋梁結構測量、結構檢測、監測、幾何尺寸測量、空間位置沖突測量、空間面積、體積測量、三維高保真建模、海上平臺、測量造船廠、電廠、化工廠等大型工業企業內部設備的測量；管道、線路測量、各類機械制造安裝。

3、建筑、古跡測量方面：建筑物內部及外觀的測量保真、古跡古建筑、雕像等、的保護測量、文物修復，古建筑測量、資料保存等古跡保護，遺址測繪，贗品成像，現場虛擬模型，現場保護性影像記錄。

4、緊急服務業：陸地偵察和攻擊測繪，監視，移動偵察，災害估計，交通事故正射圖，森林火災監控，滑坡泥石流預警，災害預警和現場監測，核泄露監測。

5、娛樂業：用于電影產品的設計，為電影演員和場景進行的設計，3D游戲的開發，虛擬博物館，虛擬旅游指導，人工成像，場景虛擬，現場虛擬。

6、采礦業：在露天礦及金屬礦井下作業，以及一些危險區域人員不方便到達的區域。