顯微鏡的鹵素燈和LED燈相比，鹵素燈，發光柔和，發黃光，發高熱，不節能，壽命短約100小時，因發黃光，對被觀察物本身的色彩有影響（可用用濾色片來進行補償）。LED燈，發白光，刺眼，對眼睛傷害大，不發熱，節能，壽命長達上萬小時。

總結而言：

顯微鏡鹵素燈：

優點：

1.光譜比較長，接近于太陽光，對于觀察而言，更加真實。

2.穿透性更強

3.對觀察人的眼睛的保護相對比較好，光線柔和。

缺點：

1.壽命較短。

2.在觀察某些物質時，失真也是有可能的，這個時候就需要使用到濾色片，一般來說，能夠滿足觀察要求。

顯微鏡LED燈：

優點：

1.價格較鹵素燈便宜

2.使用壽命相對較高

3.亮度非常高，在視野中能夠看得比較清晰。

缺點：

1.由于是單波長的光，所以一般只能針對某些物質，在很多情況下會失真。

2.亮度較高的情況下，不適合長時間觀察，很容易刺眼。

綜上所述，顯微鏡LED燈雖然是當下的一種趨勢，節能，環保，但是在用于顯微鏡光源中，也具有一些缺點，單一的波長適合觀察一些特定物質，不具備鹵素燈那種廣泛的光譜。鹵素燈雖然有廣泛的光譜，但是高發熱和壽命短，也是相比LED燈不可忽視的一些缺點。